小泉政府面臨的艱巨的任務，也許是財政改革。日本已有不小的財政赤字，而且由于人口老齡化，不論2004年的養老金體系改革或2005~2006年備受期待的醫療改革效果如何，日本財政都會受到日益嚴峻的壓力。除了這些挑戰之外，日本政府還要支付巨額的國債利息，不過在過去的7年里，由于利率的持續降低，日本的國債付息已從10. 8萬億日元降低到8. 9萬億日元。在今后的幾年里，利率就算只上升兩三個百分點，都會讓政府財政負擔陡然加重。
      自1993年以來，日本政府的年平均財政赤字為GDP的5. 7%.日本已開始著力對付的主要赤字（扣除利息開支的財政收支余額），在2004年為GDP的4. 5%.日本內閣經濟財政政策委員會委員吉川洋承認：“我們有嚴重的赤字問題?！?/span>
      2005年1月，小泉內閣以2005年預算為基礎，發布《中期經濟與財政展望》，并在3月得到日本國會的批準。在2005年預算中，日本政府連續第四年削減公共投資，限制或削減教育與國防開支。日本如果要執行小泉“三項改革”方案中的末尾一項，就需要將給予地方政府的補貼再縮減4040億日元。
      日本政府紫砂巖希望，通過維持財政開支穩定與增加稅收，可將主要赤字降至GDP的4. 1%,并在2012年實現財政平衡。2005年，日本的主要赤字為20萬億日元，為了實現上述目標，日本政府需要每年將赤字削減近3萬億日元。